Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores microsatelitales en la almeja generosa (Panopea globosa)
DOI:
https://doi.org/10.37543/oceanides.v31i1.162Palabras clave:
Microsatélites, Secuenciación de siguiente generación, Panopea globosa, Almeja generosaResumen
La almeja generosa Panopea globosa es una especie infáunica longeva y de gran tamaño que mantiene una pesquería creciente en la costa del Noroeste de México. A pesar de su demanda creciente en los mercados asiáticos, se conoce muy poco acerca de su biología. Con la finalidad de proveer nuevos marcadores genéticos para la caracterización de poblaciones silvestres, se desarrollaron nueve marcadores microsatelitales nuevos (con patrones repetidos de di-, tri-, y tetranucleotídicos) utilizando secuenciación genómica aleatoria con tecnología de secuenciación de siguiente generación (Illumina). El número de alelos por locus varió de 3 a 16 y los valores de heterocigosidad observada y esperada variaron de 0.286 a 0.650 y 0.504 a 0.906, respectivamente. Cinco microsatelites se desvían del equilibrio de Hardy-Weinberg y tres pares de microsatélites mostraron evidencia de desequilibrio de ligamiento. La mayoría de los loci son altamente informativos para estudios poblacionales y análisis de ligamiento de acuerdo con su contenido de información de polimorfismos (> 0.5) y serán útiles para incrementar el conocimiento de la estructura genética de las poblaciones silvestres de esta almeja y para coadyuvar en su pesquería sustentable.
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