Optimización de un protocolo de extracción de DNA total para la amplificación de marcadores moleculares funcionales específicos de organismos desnitrificantes.
DOI:
https://doi.org/10.37543/oceanides.v29i2.138Palabras clave:
microorganismos desnitrificantes, marcadores moleculares, extracción de DNA ambientalResumen
En esta contribución se planteó el objetivo de resolver la problemática que se enfrenta al trabajar con técnicas de biología molecular para la extracción de DNA obtenido de material particulado marino en suspensión, y se presenta un propuesta de cómo pueden ser resueltos estos problemas. Los protocolos comúnmente empleados fueron modificados para optimizar la cantidad de DNA total extraído, incrementado así la probabilidad de la amplificación de genes funcionales. Se presentan, además, resultados de la selección de
sitios hipervariables para el 16S rRNA, así como para los genes nirS, nirK y nosZ para determinación de amplicones útiles en la identificación de microorganismos participantes en la ruta de desnitrificación en lcolumna de agua.
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